杨红生研究员长期从事养殖生态学、生态免疫学、养殖环境生物修复技术和刺参遗传育种等研究，近5年来，先后主持了国家支撑计划课题1项（主持），973课题 1项（副主持）、863项目1项（副主持）和国家自然基金课题2项（主持）等课题。提出了生态工程化养殖新思路，组建了结构合理、锐意进取的创新团队。揭 示了浅海贝类养殖的自身污染机制以及对养殖海区的影响，查明了大型藻类、沉积食性动物（刺参）的生态功能，探讨了栉孔扇贝在不同环境因子影响下的生态免疫 机制，参与研制了一系列浅海和陆地工厂化养殖工程设施设备，相关技术和设备已经在山东等地沿海得以推广应用。开展了新型海珍品底播增养殖设施的研发工作， 以期解决目前海珍品增养殖专用设施缺乏的问题，提高海珍品增养殖的技术含量。发表研究论文44篇（其中 SCI 论文19篇），授权发明专利7项、实用新型专利5项，主持制定国家标准1项。获2005 年山东省科技进步奖一等奖（第五名）、2006 年国家海洋局海洋创新成果奖二等奖（第一名） ，2007中国水产科学院科技进步三等奖（第二名）和2008年国家海洋局海洋创新成果奖二等奖（第一名）。
据悉，中科院海洋所徐奎栋研究员同时获此殊荣。至此，中科院海洋所已有15位专家先后获得该项荣誉称号。
