该实验室主要针对养殖刺参存在的个体差异大、生长缓慢、度夏成活率低等一系列影响产业发展的重大问题，开展刺参良种选育、苗种繁育及其增养殖技术研究。实验室与刺参增养殖龙头企业山东东方海洋科技股份有限公司联合成立了海珍品良种选育与健康养殖实验室，在全国主要刺参养殖区广泛收集了具有耐高温能力强、生长速度快、棘刺数量多和不同体色等优良性状的刺参亲本，构建了刺参良种选育种质资源库。建立了刺参耐温速生新品系亲参筛选指标，研究了亲本在高温环境下的生理生态学特征；构建了刺参家系全人工构建技术；制定了子代苗种淘汰选择和选育目的性状评价技术体系；从分子生物学角度对选育的耐温速生刺参品系进行了鉴定和研究，筛选出了与温度性状相关的分子标记，初步建立了分子标记辅助选育技术；经过十余年的累代选育，选育出了具有生长速度快和耐高温能力强的“科东1号”刺参新品系。与未经选育的普通刺参群体相比，该新品系24月龄参生长速度提高30%以上，夏眠温度提高1.5℃左右，度夏成活率获得明显提高。近年来，逐步开展了“科东1号”刺参新品系苗种规模化繁育和养殖示范应用，取得了良好的应用效果。

我国沿海刺参棘刺数量差异很大，大部分个体的棘刺数量在30-40个之间，少数个体可达50个以上。针对刺参的棘刺性状进行了连续累代选育，选育的多刺刺参新品系平均棘刺数量为60.6±7.6个/头，多刺个体比例达到80%以上。同时，实验室还广泛收集了具有白色和紫色不同体色性状的刺参，并开展了累代选育，子代的体色性状均趋于遗传稳定。